Multiancestry association study identifies new asthma risk loci that colocalize with immune-cell enhancer marks

Demenais, F.; Margaritte-Jeannin, P.; Barnes, K. C.; Cookson, W. O. C.; Altmüller, J.; Ang, W.; Barr, R. G.; Beaty, T. H.; Becker, A. B.; Beilby, J.; Bisgaard, H.; Bjornsdottir, U. S.; Bleecker, E.; Bønnelykke, K.; Boomsma, D. I.; Bouzigon, E.; Brightling, Christopher E.; Brossard, M.; Brusselle, G. G.; Burchard, E.; Burkart, K. M.; Bush, A.; Chan-Yeung, M.; Chung, K. F.; Couto Alves, A.; Curtin, J. A.; Custovic, A.; Daley, D.; de Jongste, J. C.; Del-Rio-Navarro, B. E.; Donohue, K. M.; Duijts, L.; Eng, C.; Eriksson, J. G.; Farrall, M.; Fedorova, Y.; Feenstra, B.; Ferreira, M. A.; collaborators, Australian Asthma Genetics Consortium; Freidin, M. B.; Gajdos, Z.; Gauderman, J.; Gehring, U.; Geller, F.; Genuneit, J.; Gharib, S. A.; Gilliland, F.; Granell, R.; Graves, P. E.; Gudbjartsson, D. F.; Haahtela, T.; Heckbert, S. R.; Heederik, D.; Heinrich, J.; Heliövaara, M.; Henderson, J.; Himes, B. E.; Hirose, H.; Hirschhorn, J. N.; Hofman, A.; Holt, P.; Hottenga, J.; Hudson, T. J.; Hui, J.; Imboden, M.; Ivanov, V.; Jaddoe, V. W. V.; James, A.; Janson, C.; Jarvelin, M.-R.; Jarvis, D.; Jones, G.; Jonsdottir, I.; Jousilahti, P.; Kabesch, M.; Kähönen, M.; Kantor, D. B.; Karunas, A. S.; Khusnutdinova, E.; Koppelman, G. H.; Kozyrskyj, A. L.; Kreiner, E.; Kubo, M.; Kumar, R.; Kumar, A.; Kuokkanen, M.; Lahousse, L.; Laitinen, T.; Laprise, C.; Lathrop, M.; Lau, S.; Lee, Y.-A.; Lehtimäki, T.; Letort, S.; Levin, A. M.; Li, G.; Liang, L.; Loehr, L. R.; London, S. J.; Loth, D. W.; Manichaikul, A.; Marenholz, I.; Martinez, F. J.; Matheson, M. C.; Mathias, R. A.; Matsumoto, K.; Mbarek, H.; McArdle, W. L.; Melbye, M.; Melén, E.; Meyers, D.; Michel, S.; Mohamdi, H.; Musk, A. W.; Myers, R. A.; Nieuwenhuis, M. A. E.; Noguchi, E.; O'Connor, G. T.; Ogorodova, L. M.; Palmer, C. D.; Palotie, A.; Park, J. E.; Pennell, C. E.; Pershagen, G.; Polonikov, A.; Postma, D. S.; Probst-Hensch, N.; Puzyrev, V. P.; Raby, B. A.; Raitakari, O. T.; Ramasamy, A.; Rich, S. S.; Robertson, C. F.; Romieu, I.; Salam, M. T.; Salomaa, V.; Schlünssen, V.; Scott, R.; Selivanova, P. A.; Sigsgaard, T.; Simpson, A.; Siroux, V.; Smith, L. J.; Solodilova, M.; Standl, M.; Stefansson, K.; Strachan, D. P.; Stricker, B. H.; Takahashi, A.; Thompson, P. J.; Thorleifsson, G.; Thorsteinsdottir, U.; Tiesler, C. M. T.; Torgerson, D. G.; Tsunoda, T.; Uitterlinden, A. G.; van der Valk, R. J. P.; Vaysse, A.; Vedantam, S.; von Berg, A.; von Mutius, E.; Vonk, J. M.; Waage, J.; Wareham, N. J.; Weiss, S. T.; White, W. B.; Wickman, M.; Widén, E.; Willemsen, G.; Williams, L. K.; Wouters, I. M.; Yang, J. J.; Zhao, J. H.; Moffatt, M. F.; Ober, C.; Nicolae, D. L.

Multiancestry association study identifies new asthma risk loci that colocalize with immune-cell enhancer marks.pdf (1.44 MB)

Multiancestry association study identifies new asthma risk loci that colocalize with immune-cell enhancer marks

journal contribution

posted on 2018-08-17, 14:36 authored by F. Demenais, P. Margaritte-Jeannin, K. C. Barnes, W. O. C. Cookson, J. Altmüller, W. Ang, R. G. Barr, T. H. Beaty, A. B. Becker, J. Beilby, H. Bisgaard, U. S. Bjornsdottir, E. Bleecker, K. Bønnelykke, D. I. Boomsma, E. Bouzigon, Christopher E. Brightling, M. Brossard, G. G. Brusselle, E. Burchard, K. M. Burkart, A. Bush, M. Chan-Yeung, K. F. Chung, A. Couto Alves, J. A. Curtin, A. Custovic, D. Daley, J. C. de Jongste, B. E. Del-Rio-Navarro, K. M. Donohue, L. Duijts, C. Eng, J. G. Eriksson, M. Farrall, Y. Fedorova, B. Feenstra, M. A. Ferreira, Australian Asthma Genetics Consortium (AAGC) collaborators, M. B. Freidin, Z. Gajdos, J. Gauderman, U. Gehring, F. Geller, J. Genuneit, S. A. Gharib, F. Gilliland, R. Granell, P. E. Graves, D. F. Gudbjartsson, T. Haahtela, S. R. Heckbert, D. Heederik, J. Heinrich, M. Heliövaara, J. Henderson, B. E. Himes, H. Hirose, J. N. Hirschhorn, A. Hofman, P. Holt, J. Hottenga, T. J. Hudson, J. Hui, M. Imboden, V. Ivanov, V. W. V. Jaddoe, A. James, C. Janson, M.-R. Jarvelin, D. Jarvis, G. Jones, I. Jonsdottir, P. Jousilahti, M. Kabesch, M. Kähönen, D. B. Kantor, A. S. Karunas, E. Khusnutdinova, G. H. Koppelman, A. L. Kozyrskyj, E. Kreiner, M. Kubo, R. Kumar, A. Kumar, M. Kuokkanen, L. Lahousse, T. Laitinen, C. Laprise, M. Lathrop, S. Lau, Y.-A. Lee, T. Lehtimäki, S. Letort, A. M. Levin, G. Li, L. Liang, L. R. Loehr, S. J. London, D. W. Loth, A. Manichaikul, I. Marenholz, F. J. Martinez, M. C. Matheson, R. A. Mathias, K. Matsumoto, H. Mbarek, W. L. McArdle, M. Melbye, E. Melén, D. Meyers, S. Michel, H. Mohamdi, A. W. Musk, R. A. Myers, M. A. E. Nieuwenhuis, E. Noguchi, G. T. O'Connor, L. M. Ogorodova, C. D. Palmer, A. Palotie, J. E. Park, C. E. Pennell, G. Pershagen, A. Polonikov, D. S. Postma, N. Probst-Hensch, V. P. Puzyrev, B. A. Raby, O. T. Raitakari, A. Ramasamy, S. S. Rich, C. F. Robertson, I. Romieu, M. T. Salam, V. Salomaa, V. Schlünssen, R. Scott, P. A. Selivanova, T. Sigsgaard, A. Simpson, V. Siroux, L. J. Smith, M. Solodilova, M. Standl, K. Stefansson, D. P. Strachan, B. H. Stricker, A. Takahashi, P. J. Thompson, G. Thorleifsson, U. Thorsteinsdottir, C. M. T. Tiesler, D. G. Torgerson, T. Tsunoda, A. G. Uitterlinden, R. J. P. van der Valk, A. Vaysse, S. Vedantam, A. von Berg, E. von Mutius, J. M. Vonk, J. Waage, N. J. Wareham, S. T. Weiss, W. B. White, M. Wickman, E. Widén, G. Willemsen, L. K. Williams, I. M. Wouters, J. J. Yang, J. H. Zhao, M. F. Moffatt, C. Ober, D. L. Nicolae

We examined common variation in asthma risk by conducting a meta-analysis of worldwide asthma genome-wide association studies (23,948 asthma cases, 118,538 controls) of individuals from ethnically diverse populations. We identified five new asthma loci, found two new associations at two known asthma loci, established asthma associations at two loci previously implicated in the comorbidity of asthma plus hay fever, and confirmed nine known loci. Investigation of pleiotropy showed large overlaps in genetic variants with autoimmune and inflammatory diseases. The enrichment in enhancer marks at asthma risk loci, especially in immune cells, suggested a major role of these loci in the regulation of immunologically related mechanisms.

History

Citation

Nature Genetics, 2018, 50 (1), pp. 42-53

Author affiliation

/Organisation/COLLEGE OF LIFE SCIENCES/School of Medicine/Department of Infection, Immunity and Inflammation

Version

AM (Accepted Manuscript)

Published in

Nature Genetics

Publisher

Nature Publishing Group

eissn

1546-1718

Acceptance date

2017-11-08

Copyright date

2017

Available date

2018-08-17

Publisher DOI

https://doi.org/10.1038/s41588-017-0014-7

Publisher version

https://www.nature.com/articles/s41588-017-0014-7

Language

en

Administrator link

https://leicester.figshare.com/account/articles/10237691

Usage metrics

Keywords

IR content

Licence

Exports

RefWorks

BibTeX

Ref. manager

Endnote

DataCite

NLM

DC

Multiancestry association study identifies new asthma risk loci that colocalize with immune-cell enhancer marks

History

Citation

Author affiliation

Version

Published in

Publisher

eissn

Acceptance date

Copyright date

Available date

Publisher DOI

Publisher version

Language

Administrator link

Usage metrics

Categories

Keywords

Licence

Exports