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posted on 2020-12-21, 09:16 authored by Giulio Spinozzi, Valentina Tini, Alessia Adorni, Brunangelo Falini, Maria Paola MartelliAdditional file 3: Table S2. List of genes differentially expressed and relative Fold Changes identify by HISAT2-StringTie-Ballgown pipeline.
Funding
European Research Council ELIXIR-IIB CINECA
History
References
- 10.1016/j.beha.2015.10.005
- 10.1371/journal.pone.0190152
- 10.1186/gb-2013-14-9-r95
- 10.1038/nmeth.4106
- 10.1093/nar/gkw448
- 10.1093/bioinformatics/btv272
- 10.1093/bioinformatics/btp324
- 10.1093/bioinformatics/btr509
- 10.1093/bioinformatics/btp352
- 10.1186/gb-2013-14-4-r36
- 10.1038/nmeth.3317
- 10.1093/bioinformatics/bts635
- 10.1093/bioinformatics/bts356
- 10.1093/bioinformatics/btt656
- 10.1038/nprot.2012.016
- 10.1093/bioinformatics/btp616
- 10.1186/gb-2010-11-3-r25
- 10.1186/s13059-014-0550-8
- 10.1038/75556
- 10.1089/omi.2011.0118
- 10.1093/nar/gkw1092
- 10.1093/nar/28.1.27
- 10.1093/nar/gkv1070
- 10.1093/bioinformatics/btt285
- 10.1038/sj.leu.2403899
- 10.1016/j.leukres.2009.09.019
- 10.1186/s12859-017-1937-9
- 10.1038/nbt.3519
- 10.1038/nbt.1621
- 10.1038/nbt.3122
- 10.1038/nbt.3172
- 10.1038/nature10836
- 10.1126/science.1213847
- 10.2202/1544-6115.1034
- 10.1038/s41375-019-0399-7
