Strain name: CCUG 27631
Filepath: ../polyG/campy.new\740401-1028383162.gb
Species: C. hyointestinalis
Created: 2018-09-09 12:25:37 (W. Europe Summer Time)
TractNo | Contig | Location | Tract | On length | Gene Group | Offset from gene | Gene | Length | Function | NCTC 11168 | 81-176 | PT14 | 00-0949 | 00-1597 | 00-2425 | 00-2426 | 00-2538 | 00-2544 | 00-6200 | 01-1512 | 269.97 | 4031 | 32488 | 35925B2 | 81116; NCTC 11828 | CG8421 | CJ677CC519 | CJM1cam | F38011 | IA3902 | ICDCCJ07001 | M1 | MTVDSCj20 | NCTC11351 | OD267 | R14 | RM1221 | RM1285 | RM3194 | RM3196 | RM3197 | S3 | WP2202 | YH001 | 15-537360 | BFR-CA-9557 | CVM N29710 | FB1 | HC2-48 | OR12 | RM1875 | RM4661 | RM5611 | YH501 | 13826 | ATCC 33237 | 525.92 | 03-427 | 04/554 | 82-40 | 84-112 | 97/608 | SP3 | cfvi03/293 | pet-3 | ATCC 33236 | ATCC BAA-381 | CCUG 27631 | LMG 9260 | 1485E | 2463D | RM11343 | NCTC 12927 | CCUG 22395 | LMG 11760 | NCTC 11845 | RM2100; ATCC BAA-1060D | RM16701 | RM16712 | Slaughter Beach | LMG 23910 | RM16704 | LMG 24374 | LMG 24377 | RIGS 9880 | LMG 24379 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | CP015576 | 20054 | G9 | 9 | 321 | 0 | CHL_0019 | 93 | No annotation data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | CP015576 | 20063 | A10 | None | 322 | -8 | 8bp upstream of CHL_0019 | 93 | No annotation data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | CP015576 | 32104 | C10 | 9 | 323 | 0 | CHL_0034 | 817 | PAS sensor-containing diguanylate cyclase/phosphodiesterase | CFT03427_1680 | CFF04554_1733 | CFF8240_1735 | CSG_18650 | CFV97608_1860 | CFTSP3_1745 | CFVI03293_1757 | CR44_08530 | CHL_0034 | CHH_1716 | CIG1485E_1619 | CIG2463D_1816 | CIG11343_1555 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | CP015576 | 67089 | G8 | 7 | 324 | 0 | CHL_0067 | 488 | No annotation data | CHL_0067 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | CP015576 | 68442 | G7 | 6 | 325 | 0 | CHL_0068 | 386 | No annotation data | CHL_0068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | CP015576 | 69702 | G9 | 9 | 326 | 0 | CHL_0070 | 315 | SAM-dependent methyltransferase | CHL_0070 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 | CP015576 | 73760 | A10 | 10 | 327 | 0 | CHL_0074 | 228 | metallophosphatase | CCC13826_0534 | CHL_0074 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 | CP015576 | 92430 | G9 | 9 | 328 | 0 | CHL_0091 | 107 | No annotation data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8 | CP015576 | 104934 | G10 | 10 | 329 | 0 | CHL_0105 | 543 | type III restriction/modification system, mod subunit | CHL_0105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9 | CP015576 | 126722 | G9 | 9 | 330 | 0 | CHL_0142 | 206 | formyltransferase domain-containing protein | CHL_0142 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10 | CP015576 | 176416 | G9 | 9 | 8 | 0 | CHL_0193 | 430 | hypothetical protein | CHL_0193 | UPTC3659_0914 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | CP015576 | 199173 | C9 | None | 331 | -369 | 369bp upstream of CHL_0216 | 57 | hypothetical protein | CHL_0216 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 | CP015576 | 214684 | G8 | 8 | 332 | 0 | CHL_0231 | 406 | ATP-grasp domain-containing protein | CJH_06665 | CHL_0231 | CHH_1590 | CIG1485E_1500 | CIG2463D_1693 | CIG11343_1444 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | CP015576 | 221312 | G8 | 8 | 333 | 0 | CHL_0238 | 246 | WbqC family protein | CHL_0238 | CHH_1597 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 | CP015576 | 223021 | G9 | 9 | 334 | 0 | CHL_0240 | 340 | aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family | CHL_0240 | CHH_1599 | CIG1485E_1504 | CIG2463D_1701 | CIG11343_1453 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 | CP015576 | 225205 | G9 | 10 | 239 | 0 | CHL_0243 | 138 | No annotation data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16 | CP015576 | 225393 | G10 | 10 | 335 | 0 | CHL_0243 | 69 | No annotation data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | CP015576 | 226501 | G9 | 9 | 241 | 0 | CHL_0244 | 229 | SAM-dependent methyltransferase | CFT03427_1511 CFT03427_1512 | CFF04554_1564 CFF04554_1563 | CFF8240_1555 CFF8240_1554 | CSG_16900 CSG_16910 | CFV97608_1688 | CFTSP3_1575 CFTSP3_1576 | CFVI03293_1586 | CR44_07665 CR44_07670 | CHL_0244 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
18 | CP015576 | 269211 | G10 | None | 336 | -72 | 72bp upstream of CHL_0291 | 95 | hypothetical protein | CHL_0291 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 | CP015576 | 376278 | C9 | 9 | 337 | 0 | CHL_0424 | 639 | TonB-dependent receptor | CHL_0424 | CHH_0268 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
20 | CP015576 | 394772 | G9 | 9 | 338 | 0 | CHL_0448 | 532 | SAM-dependent methyltransferase | CHL_0448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
21 | CP015576 | 444387 | G10 | 10 | 339 | 0 | CHL_0502 | 351 | glycosyltransferase, family 1 | CHAB381_0661 | CHL_0502 | CIG1485E_1412 | CIG2463D_1603 | CIG11343_1357 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | CP015576 | 610885 | C10 | 10 | 340 | 0 | CHL_0686 | 234 | carboxy-S-adenosyl-L-methionine synthase | Cj0590 | CJJ81176_0618 | A911_02880 | PJ16_02945 | PJ17_02860 | N135_00641 | N564_00578 | N565_00624 | N755_00623 | PJ18_02950 | PJ19_03210 | JJD26997_1078 | BN867_05990 | M635_07315 | UC78_0574 | C8J_0552 | CJ8421_02880 | RC25_02845 | CJM1cam_0567 | CJH_02995 | CJSA_0558 | ICDCCJ07001_538 | CJM1_0567 | MTVDSCj20_0610 | ERS445056_00577 | A0W68_02775 | H730_03825 | CJE0693 | CjjRM1285_0563 | AXW77_02890 | CjjRM3196_0569 | CjjRM3197_0569 | CJS3_0580 | A0W69_03820 | QZ67_00605 | N149_1222 | AB430_07990 | G157_02500 | VC76_06330 | AR446_01850 | ATE51_01042 | YSQ_02555 | YSS_06850 | YSU_02580 | A6K30_02520 | CCC13826_2026 | CCON33237_1306 | CCV52592_1562 | CFT03427_1086 | CFF04554_1136 | CFF8240_1109 | CSG_8860 | CFV97608_1161 | CFTSP3_1148 | CFVI03293_1106 | CR44_05525 | CGRAC_0902 | CHAB381_1013 | CHL_0686 | CHH_0651 | CIG1485E_1154 | CIG2463D_1245 | CIG11343_1108 | CINS_0656 | UPTC4110_0691 | CONCH_0685 | UPTC3659_0775 | Cla_0676 | UPTC16701_0682 | UPTC16712_0687 | CD56_03690 | CPEL_0744 | CAQ16704_0856 | CSUB8521_0721 | CSUB8523_0809 | CUREO_0799 | CVOL_0670 |
23 | CP015576 | 627618 | C10 | 10 | 341 | 0 | CHL_0706 | 352 | diguanylate cyclase | CHL_0706 | CHH_0669 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | CP015576 | 707831 | G8 | 7 | 342 | 0 | CHL_0780 | 765 | No annotation data | CHL_0780 CHL_0782 | CHH_0746 CHH_1466 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25 | CP015576 | 708027 | C9 | None | 343 | -138 | 138bp upstream of CHL_0780 | 39 | No annotation data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26 | CP015576 | 711394 | G8 | 7 | 342 | 0 | CHL_0782 | 764 | No annotation data | CHL_0780 CHL_0782 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
27 | CP015576 | 711590 | C9 | None | 344 | -138 | 138bp upstream of CHL_0782 | 30 | No annotation data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
28 | CP015576 | 714391 | G8 | 7 | 342 | 0 | CHL_0783 | 764 | No annotation data | CHL_0783 | CHH_0746 CHH_1466 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
29 | CP015576 | 714587 | C9 | None | 345 | -138 | 138bp upstream of CHL_0783 | 32 | No annotation data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
30 | CP015576 | 725744 | T10 | None | 346 | -44 | 44bp upstream of CHL_0793 | 494 | hypothetical protein | CHL_0793 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
31 | CP015576 | 757953 | G7 | None | 347 | -37 | 37bp upstream of CHL_0832 | 451 | hypothetical protein | CHL_0832 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
32 | CP015576 | 758082 | C9 | None | 347 | -166 | 166bp upstream of CHL_0832 | 451 | hypothetical protein | CHL_0832 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
33 | CP015576 | 794720 | G8 | 8 | 348 | 0 | CHL_0862 | 377 | No annotation data | CCV52592_0864 | CHL_0862 | CHH_0868 | CIG1485E_0946 | CIG2463D_0946 | CIG11343_0927 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
34 | CP015576 | 799523 | G9 | 9 | 349 | 0 | CHL_0867 | 173 | PAS sensor-containing signal-transduction protein | CCC13826_1233 | CCON33237_0927 | CCV52592_1962 | CFT03427_0992 | CFF04554_1002 | CFF8240_1012 | CSG_9820 | CFV97608_1069 | CFTSP3_1045 | CFVI03293_0747 | CR44_05040 | CHL_0867 | CVOL_0940 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
35 | CP015576 | 933768 | G9 | None | 350 | -5 | 5bp upstream of CHL_1002 | 117 | hypothetical protein | CFF04554_1101 | CSG_7100 CSG_13300 | CFV97608_1336 CFV97608_0730 | CFTSP3_0693 | CFVI03293_1045 | CHL_1002 | CIG2463D_1459 CIG2463D_1362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
36 | CP015576 | 966973 | G10 | 10 | 233 | 0 | CHL_1051 | 618 | type III restriction/modification system, mod subunit | CR44_04865 | CHL_1051 | CHH_1055 | CIG11343_0145 CIG11343_0014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
37 | CP015576 | 1031617 | G9 | 9 | 351 | 0 | CHL_1115 | 198 | No annotation data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
38 | CP015576 | 1072892 | G9 | 9 | 352 | 0 | CHL_1160 | 388 | glycosyltransferase, family 8 | CHL_1160 | CAQ16704_0350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
39 | CP015576 | 1113545 | C9 | None | -1 | -322 | 322bp upstream of CHL_1204 | 2 | 16S ribosomal RNA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
40 | CP015576 | 1147889 | C8 | None | 353 | -126 | 126bp upstream of CHL_1240 | 60 | hypothetical protein | CFT03427_1020 | CFTSP3_1082 | CR44_05180 | CHL_1240 | CHH_1113 | CIG11343_0700 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
41 | CP015576 | 1243058 | G9 | None | 354 | -12 | 12bp upstream of CHL_1325 | 126 | receiver domain protein | CFT03427_1246 | CFF04554_1296 | CFF8240_1269 | CSG_14160 | CFV97608_1420 | CFTSP3_1308 | CFVI03293_1320 | CR44_06290 | CHL_1325 | CHH_1282 | CIG1485E_1295 | CIG2463D_1428 | CIG11343_1246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
42 | CP015576 | 1284134 | G9 | None | 220 | -38 | 38bp upstream of CHL_1373 | 197 | outer membrane beta-barrel domain protein | CCC13826_0292 CCC13826_0288 CCC13826_0601 | CCON33237_1789 | CCV52592_1369 | CHL_1373 | CHH_0837 | CIG1485E_0807 | CIG2463D_0808 | CIG11343_0771 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
43 | CP015576 | 1340639 | G8 | 8 | 355 | 0 | CHL_1435 | 424 | aminoglycoside N3'-acetyltransferase | CHL_1435 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
44 | CP015576 | 1342905 | G9 | 9 | 356 | 0 | CHL_1437 | 260 | short-chain dehydrogenase/reductase | CHL_1437 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
45 | CP015576 | 1404282 | C10 | None | -1 | -322 | 322bp upstream of CHL_1489 | 2 | 16S ribosomal RNA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
46 | CP015576 | 1478852 | G10 | 11 | 357 | 0 | CCUG 27631 [0] | 545 | No data, identified by script | CCV52592_0568 | CFT03427_1588 | CFF04554_1638 | CFF8240_1636 | CSG_17700 | CFV97608_1763 | CFTSP3_1653 | CFVI03293_1660 | CR44_08070 | CHL_1726 CCUG 27631 [0] | CHH_1463 CHH_1631 CHH_1632 | CIG1485E_1540 CIG1485E_1539 | CIG2463D_1736 CIG2463D_1737 | CIG11343_1485 | CAQ16704_0162 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
47 | CP015576 | 1604938 | G8 | None | 358 | -112 | 112bp upstream of CHL_1682 | 104 | hypothetical protein | CHL_1682 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
48 | CP015576 | 1611129 | G10 | 10 | 29 | 0 | CHL_1689 | 243 | formyltransferase domain-containing protein | JJD26997_0414 | AR446_01620 | YSU_02350 | CHL_1689 | CIG1485E_0401 | CIG11343_0350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
49 | CP015576 | 1614991 | G10 | 10 | 15 | 0 | CHL_1692 | 424 | putative Zn-peptidase, M28 family (DUF2172 domain) | Cj1295 | A911_06290 | PJ16_07255 | PJ17_06865 | N135_01383 | N564_01313 | N565_02300 | N755_01345 | PJ18_06675 | PJ19_07255 | JJD26997_0427 | BN867_12880 | M635_08875 | UC78_1247 | C8J_1238 | CJ8421_06450 | RC25_06170 | CJM1cam_1277 | CJH_06560 | CJSA_1233 | ICDCCJ07001_1243 | CJM1_1277 | MTVDSCj20_1301 | ERS445056_01406 | A0W68_06980 | H730_07425 | CJE1487 | CjjRM1285_1309 | AXW77_06385 | CjjRM3196_1311 | CjjRM3197_1311 | CJS3_1392 | A0W69_07665 | QZ67_01430 | N149_1256 | AB430_08160 | VC76_06500 | AR446_01680 | ATE51_00974 | YSQ_02385 | YSS_07030 | YSU_02410 | A6K30_02350 | CFT03427_1431 | CFF04554_1483 | CFF8240_1468 | CSG_16050 | CFV97608_1605 | CFTSP3_1495 | CFVI03293_1505 | CR44_07250 | CHL_1692 | CHH_1509 | CIG1485E_0398 | CIG2463D_0403 | CIG11343_0347 | CINS_1263 | UPTC4110_1286 | CONCH_1253 | UPTC3659_1523 | Cla_1300 | UPTC16701_1283 | UPTC16712_1302 | CD56_06695 | CPEL_1409 | CAQ16704_1312 | CSUB8521_1489 | CSUB8523_1585 | CVOL_1279 CVOL_1280 | ||||||||
50 | CP015576 | 1619644 | G9 | 9 | 359 | 0 | CHL_1698 | 362 | type I restriction/modification system, S subunit | CHL_1698 | CIG11343_0101 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
51 | CP015576 | 1628790 | G9 | None | 35 | -68 | 68bp upstream of CHL_1706 | 128 | putative phospholipase / phosphodiesterase | CHL_1706 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
52 | CP015576 | 1629050 | G11 | None | 360 | -4 | 4bp upstream of CHL_1707 | 65 | No annotation data | CHL_1707 |