CFF04554_0475 vs: CFF8240_0465 in 82-40 (Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40, complete genome.)
Gene length: 3859bp / 1286aa PV: Yes
Function: No annotation data

Score: 3102.00 bits: 1341.91 e-value: 0.000000
length: 776 gaps: 0 id: 758 positives: 765 coverage: 0.96 query coverage 0.97

CF..4_0475 +1 MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPN +100
MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPN
CF..0_0465 +456245 MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPN +456542

CF..4_0475 +101 NQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNFVTKIAGGMKNAELIGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGYGQEFAAQYLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK +200
NQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTN VTKIAGGMKNAELIGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGY Q + AQ+LKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK
CF..0_0465 +456545 NQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNSVTKIAGGMKNAELIGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGYEQGYIAQHLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK +456842

CF..4_0475 +201 KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKN +300
KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKN
CF..0_0465 +456845 KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKN +457142

CF..4_0475 +301 PIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGGGSA +400
PIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGGGSA
CF..0_0465 +457145 PIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGGGSA +457442

CF..4_0475 +401 TNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANIADIYGGKsisnnsianknsitisGGTLQVTNIYGGHSAKDAnensiqisnggninni +500
TNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTAN+ADIYGGKSISNNSIANKNSITISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSIQISNGGNINNI
CF..0_0465 +457445 TNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANVADIYGGKSISNNSIANKNSITISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSIQISNGGNINNI +457742

CF..4_0475 +501 vggHAQDHtnlntinitggtiQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATKNSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSVTISGGKVTNSI +600
VGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSAT+NSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSVTISGGKVTNSI
CF..0_0465 +457745 VGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATRNSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSVTISGGKVTNSI +458042

CF..4_0475 +601 YGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTENSVNISNGTITG +700
YGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTENSVNISNGTITG
CF..0_0465 +458045 YGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTENSVNISNGTITG +458342

CF..4_0475 +701 NIYGGYAKVASKNVVAISGGTIVgniyggyssgggsstgnkiiisgsPDLSNATLYGADGKIAAPPPIEQNLAPKR +776
NIYGGYAKVA KNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAAPPP + ++
CF..0_0465 +458345 NIYGGYAKVAFKNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAAPPPHRAKFSTQK +458570

Score: 2050.00 bits: 888.12 e-value: 0.000000
length: 533 gaps: 18 id: 479 positives: 485 coverage: 0.96 query coverage 0.97

CF..4_0475 +755 LYGAD-GKIAAPPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQ +854
LY A G+ PPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQ
CF..0_0465 +458505 LYTAPMGR*LHPPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQ +458802

CF..4_0475 +855 FNANNLNLNEGDTITLIGGFDDAKITGGDDANSiipipipapqpapipvipapavpivtpiidpvipapiipapvvLVSEP-----------------KK +954
FNANNLNLNEGDTITLIGGFDDAKITGGDDANSIIPIPIPAPQPAP+ P PI + + V + +P KK
CF..0_0465 +458805 FNANNLNLNEGDTITLIGGFDDAKITGGDDANSIIPIPIPAPQPAPVVPAPVIPAPIPVIPAPVPVIPAPVVPIVTPIIDPVIPAPIIPAPVVLVSEPKK +459102

CF..4_0475 +955 TLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVsqasssnsfaalsNGRFRYKTGSHIDINGFSLIVGVSKEI +1054
TLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLIVGVSKEI
CF..0_0465 +459105 TLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLIVGVSKEI +459402

CF..4_0475 +1055 ESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHIGLGRifn +1154
ESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHIGLGRIFN
CF..0_0465 +459405 ESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHIGLGRIFN +459702

CF..4_0475 +1155 indiniidLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDSTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAMLEIGASIT +1254
INDINIIDLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDSTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAMLEIGASIT
CF..0_0465 +459705 INDINIIDLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDSTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAMLEIGASIT +460002

CF..4_0475 +1255 PTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKARYKF +1287
PTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKARYKF
CF..0_0465 +460005 PTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKARYKF +460101

CFF04554_0475 vs: CSG_5400 in 84-112 (Campylobacter fetus subsp. venerealis str. 84-112, complete genome.)
Gene length: 2983bp / 994aa PV: Yes
Function: putative autotransporter protein

Score: 1734.00 bits: 751.80 e-value: 0.000000
length: 487 gaps: 0 id: 474 positives: 477 coverage: 0.99 query coverage 0.77

CF..4_0475 +290 VTIATHSSLKNPIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGT +389
V IATHSSLKNPIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGG SQVASENLVIISGGT
CSG_5400 +535372 VIIATHSSLKNPIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGSSQVASENLVIISGGT +535669

CF..4_0475 +390 INVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANIADIYGGKsisnnsianknsitisGGTLQVTNIYGGHSAKDAnensi +489
INVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANIADIYGGKSISNNSIANKNSITISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSI
CSG_5400 +535672 INVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANIADIYGGKSISNNSIANKNSITISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSI +535969

CF..4_0475 +490 qisnggninnivggHAQDHtnlntinitggtiQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATKNSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSV +589
QISNGGNINNIVGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATKNSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSV
CSG_5400 +535972 QISNGGNINNIVGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATKNSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSV +536269

CF..4_0475 +590 TISGGKVTNSIYGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTEN +689
TISGGKVTNSIYGGKSTN NANKNSV ISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTEN
CSG_5400 +536272 TISGGKVTNSIYGGKSTNSNANKNSVIISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTEN +536569

CF..4_0475 +690 SVNISNGTITGNIYGGYAKVASKNVVAISGGTIVgniyggyssgggsstgnkiiisgsPDLSNATLYGADGKIAAPPPIEQNLAPKR +776
SVNISNGTITGNIYGGYAKVASKNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAAPPP + ++
CSG_5400 +536572 SVNISNGTITGNIYGGYAKVASKNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAAPPPHRAKFSTQK +536830

Score: 2060.00 bits: 892.43 e-value: 0.000000
length: 516 gaps: 1 id: 506 positives: 507 coverage: 0.99 query coverage 0.77

CF..4_0475 +755 LYGAD-GKIAAPPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQ +854
LY A G+ PPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQ
CSG_5400 +536765 LYTAPMGR*LHPPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQ +537062

CF..4_0475 +855 FNANNLNLNEGDTITLIGGFDDAKITGGDDANSiipipipapqpapipvipapavpivtpiidpvipapiipapvvLVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNS +954
FNANNLNLNEGDTITLIGGFDDAKITGGDDANSIIPIPIPAPQPAPIPVIPAPAVPIVTPIIDPVIPAPIIPAPVVLVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNS
CSG_5400 +537065 FNANNLNLNEGDTITLIGGFDDAKITGGDDANSIIPIPIPAPQPAPIPVIPAPAVPIVTPIIDPVIPAPIIPAPVVLVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNS +537362

CF..4_0475 +955 KFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVsqasssnsfaalsNGRFRYKTGSHIDINGFSLIVGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYN +1054
KFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLIVGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYN
CSG_5400 +537365 KFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLIVGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYN +537662

CF..4_0475 +1055 SYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHIGLGRifnindiniidLYSKILYSE +1154
SYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHIGLGRIFNIND NIIDLYSKILYSE
CSG_5400 +537665 SYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHIGLGRIFNINDTNIIDLYSKILYSE +537962

CF..4_0475 +1155 QGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDSTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAMLEIGASITPTNYKAFNANFNLQLFT +1254
QGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELND TNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAMLEIGASITPTNYKAFNANFNLQLFT
CSG_5400 +537965 QGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDGTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAMLEIGASITPTNYKAFNANFNLQLFT +538262

CF..4_0475 +1255 GVKSGISGGLKARYKF +1270
GVKSGISGGLKA YKF
CSG_5400 +538265 GVKSGISGGLKALYKF +538310

CFF04554_0475 vs: CFV97608_0520 in 97/608 (Campylobacter fetus subsp. venerealis 97/608.)
Gene length: 5499bp / 1833aa PV: Yes
Function: No annotation data

Score: 1329.00 bits: 577.10 e-value: 0.000000
length: 291 gaps: 0 id: 279 positives: 284 coverage: 0.68 query coverage 0.99

CF..4_0475 +1 MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPN +100
MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTI+GNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGN YPN
CF..8_0520 +506881 MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTITGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNRYPN +507178

CF..4_0475 +101 NQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNFVTKIAGGMKNAELIGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGYGQEFAAQYLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK +200
QKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTN VT IAGG+KNAEL+GGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGY Q + AQ+LKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK
CF..8_0520 +507181 SQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNSVTTIAGGVKNAELMGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGYEQGYIAQHLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK +507478

CF..4_0475 +201 KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVT +291
KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVT
CF..8_0520 +507481 KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVT +507751

Score: 3789.00 bits: 1638.26 e-value: 0.000000
length: 981 gaps: 1 id: 973 positives: 973 coverage: 0.68 query coverage 0.99

CF..4_0475 +290 VTIATHSSLKNPIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGT +389
V IATHSSLKNPIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGG SQVASENLVIISGGT
CF..8_0520 +509434 VIIATHSSLKNPIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGSSQVASENLVIISGGT +509731

CF..4_0475 +390 INVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANIADIYGGKsisnnsianknsitisGGTLQVTNIYGGHSAKDAnensi +489
INVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANIADIYGGKSISNNSIANKNSITISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSI
CF..8_0520 +509734 INVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANIADIYGGKSISNNSIANKNSITISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSI +510031

CF..4_0475 +490 qisnggninnivggHAQDHtnlntinitggtiQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATKNSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSV +589
QISNGGNINNIVGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATKNSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSV
CF..8_0520 +510034 QISNGGNINNIVGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATKNSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSV +510331

CF..4_0475 +590 TISGGKVTNSIYGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTEN +689
TISGGKVTNSIYGGKSTN NANKNSV ISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTEN
CF..8_0520 +510334 TISGGKVTNSIYGGKSTNSNANKNSVIISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTEN +510631

CF..4_0475 +690 SVNISNGTITGNIYGGYAKVASKNVVAISGGTIVgniyggyssgggsstgnkiiisgsPDLSNATLYGADGKIAA-PPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQ +789
SVNISNGTITGNIYGGYAKVASKNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAA PPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQ
CF..8_0520 +510634 SVNISNGTITGNIYGGYAKVASKNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAAPPPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQ +510931

CF..4_0475 +790 PLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNEGDTITLIGGFDDAKITGGDDANSii +889
PLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNEGDTITLIGGFDDAKITGGDDANSII
CF..8_0520 +510934 PLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNEGDTITLIGGFDDAKITGGDDANSII +511231

CF..4_0475 +890 pipipapqpapipvipapavpivtpiidpvipapiipapvvLVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLAS +989
PIPIPAPQPAPIPVIPAPAVPIVTPIIDPVIPAPIIPAPVVLVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLAS
CF..8_0520 +511234 PIPIPAPQPAPIPVIPAPAVPIVTPIIDPVIPAPIIPAPVVLVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLAS +511531

CF..4_0475 +990 NEGIKNMVsqasssnsfaalsNGRFRYKTGSHIDINGFSLIVGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKL +1089
NEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLIVGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKL
CF..8_0520 +511534 NEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLIVGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKL +511831

CF..4_0475 +1090 ANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHIGLGRifnindiniidLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELND +1189
ANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHIGLGRIFNIND NIIDLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELND
CF..8_0520 +511834 ANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHIGLGRIFNINDTNIIDLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELND +512131

CF..4_0475 +1190 STNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAMLEIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKARYKF +1270
TNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAMLEIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKA YKF
CF..8_0520 +512134 GTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAMLEIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKALYKF +512374

CFF04554_0475 vs: CFVI03293_0466 in cfvi03/293 (Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293, complete genome.)
Gene length: 3860bp / 1286aa PV: Yes
Function: No annotation data

Score: 1727.00 bits: 748.78 e-value: 0.000000
length: 369 gaps: 0 id: 363 positives: 365 coverage: 1.10 query coverage 1.12

CF..4_0475 +1 MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPN +100
MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPN
CF..3_0466 +459812 MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPN +460109

CF..4_0475 +101 NQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNFVTKIAGGMKNAELIGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGYGQEFAAQYLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK +200
NQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTN VTKIAGGMKNAELIGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGY Q + AQ+LKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK
CF..3_0466 +460112 NQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNSVTKIAGGMKNAELIGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGYEQGYIAQHLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK +460409

CF..4_0475 +201 KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKN +300
KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKN
CF..3_0466 +460412 KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKN +460709

CF..4_0475 +301 PIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEI +369
PIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEI
CF..3_0466 +460712 PIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEI +460916

Score: 106.00 bits: 49.54 e-value: 0.000001
length: 409 gaps: 115 id: 118 positives: 162 coverage: 1.10 query coverage 1.12

CF..4_0475 +52 TDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPNNQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNFVTKIAGGMKNAELIGGYATTS +151
T+ +NN VTISG + + IYGG ++ KS+N N VT G A++ GG + +
CF..3_0466 +461011 TNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNAN----------------------------------------------KSANENKVTITEGTANVADIYGGKSIS- +461308

CF..4_0475 +152 ESKNNTVLIDNKTVFYGGYGQEFAAQYLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK-----KDIELTATSD--NQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDA +251
NN++ N GG Q +NIYGG+S A N ++I +I D N I GG +++ N ++S N V ++
CF..3_0466 +461311 ---NNSIANKNSITISGGTLQV-------TNIYGGHSAKDANENSIQISNGGNINNIVGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGG +461608

CF..4_0475 +252 KLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKNPIIDIFGGLSKDA-TTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIK +351
+ +IIGG++ S A N V ++ T A I GG +A +N VTI SG + IY
CF..3_0466 +461611 VV------------ENYIIGGKSY--------SGSATRNSVIVSTDTSAI----------IIGGQGTNANAIENSVTI----------SGGKVTNSIY-- +461908

CF..4_0475 +352 GGNGYH-QSNRNKVYIQ-DNSKIKAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNA-NKSANENKVTITEGT +451
GG +N+N V I DN+ I + I GG ASEN + IS G I I GG T + N VTISGG VTS IYGG + N + EN V I+ GT
CF..3_0466 +461911 GGKSTNGNANKNSVTISGDNTSI--TDKIYGGEGISASENRIEISNGKIS-GEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSN-IYGGKSLNGNSTENSVNISNGT +462208

CF..4_0475 +452 ANIADIYGG +460
+IYGG
CF..3_0466 +462211 I-TGNIYGG +462235

Score: 126.00 bits: 58.17 e-value: 0.000000
length: 266 gaps: 50 id: 84 positives: 116 coverage: 1.10 query coverage 1.12

CF..4_0475 +217 IAGGFVEAPNKNNGKAI-SSNNSVIITDAKLTAGLRFG---NKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKNPIIDIFGGLSKD +316
I+GG + P G A ++NN V I+ K+T+ +G NK + E + YG N + N + +L+ + +I+GG S
CF..3_0466 +460963 ISGGTINVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANVADIYGGKSISNNSIANKNSITISGGTLQ--VTNIYGGHSAK +461260

CF..4_0475 +317 ATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGG----GSAT------- +416
+N + I IN I GG ++N N + I + I++V GG VAS+N V +SGG + IGG GSAT
CF..3_0466 +461263 DANENSIQISNGGNINN------------IVGGHAQDHTNLNTINITGGT-IQSVT--GGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATRNSVIVS +461560

CF..4_0475 +417 ---------------NATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNA-NKSANENKVTITEGTANIAD-IYGGK +482
NA N VTISGGKVT S IYGG + N AN+N VTI+ I D IYGG+
CF..3_0466 +461563 TDTSAIIIGGQGTNANAIENSVTISGGKVTNS-IYGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGE +461758

Score: 1965.00 bits: 851.45 e-value: 0.000000
length: 522 gaps: 0 id: 515 positives: 518 coverage: 1.10 query coverage 1.12

CF..4_0475 +365 KAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANIADIYGGKsisnnsianknsit +464
K+ IGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTAN+ADIYGGKSISNNSIANKNSIT
CF..3_0466 +460903 KSRRNIGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANVADIYGGKSISNNSIANKNSIT +461200

CF..4_0475 +465 isGGTLQVTNIYGGHSAKDAnensiqisnggninnivggHAQDHtnlntinitggtiQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATKNSV +564
ISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSIQISNGGNINNIVGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSAT+NSV
CF..3_0466 +461203 ISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSIQISNGGNINNIVGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATRNSV +461500

CF..4_0475 +565 IVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSVTISGGKVTNSIYGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNS +664
IVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSVTISGGKVTNSIYGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNS
CF..3_0466 +461503 IVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSVTISGGKVTNSIYGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNS +461800

CF..4_0475 +665 VTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTENSVNISNGTITGNIYGGYAKVASKNVVAISGGTIVgniyggyssgggsstgnkiiisgsPDLSNATLYGADGKIAA +764
VTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTENSVNISNGTITGNIYGGYAKVA KNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAA
CF..3_0466 +461803 VTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTENSVNISNGTITGNIYGGYAKVAFKNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAA +462100

CF..4_0475 +765 PPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNEG +864
PPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNEG
CF..3_0466 +462103 PPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNEG +462400

CF..4_0475 +865 DTITLIGGFDDAKITGGDDANS +886
DTITLIGGFDDAKITGGDDANS
CF..3_0466 +462403 DTITLIGGFDDAKITGGDDANS +462466

Score: 1523.00 bits: 660.79 e-value: 0.000000
length: 340 gaps: 0 id: 340 positives: 340 coverage: 1.10 query coverage 1.12

CF..4_0475 +930 LVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVsqasssnsfaalsNGRFRYKTGSHIDINGFSLI +1029
LVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLI
CF..3_0466 +462649 LVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLI +462946

CF..4_0475 +1030 VGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHI +1129
VGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHI
CF..3_0466 +462949 VGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHI +463246

CF..4_0475 +1130 GLGRifnindiniidLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDSTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAML +1229
GLGRIFNINDINIIDLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDSTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAML
CF..3_0466 +463249 GLGRIFNINDINIIDLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDSTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAML +463546

CF..4_0475 +1230 EIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKARYKF +1269
EIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKARYKF
CF..3_0466 +463549 EIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKARYKF +463666