CFF8240_0465 vs: CFF04554_0475 in 04/554 (Campylobacter fetus subsp. fetus 04/554, complete genome.)
Gene length: 3810bp / 1270aa PV: Yes
Function: autotransporter domain proteinScore: 3682.00 bits: 1592.10 e-value: 0.000000
length: 887 gaps: 1 id: 877 positives: 881 coverage: 0.96 query coverage 0.95
CF..0_0465 +1 MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPN +100
MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPN
CF..4_0475 +467757 MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPN +468054
CF..0_0465 +101 NQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNSVTKIAGGMKNAELIGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGYEQGYIAQHLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK +200
NQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTN VTKIAGGMKNAELIGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGY Q + AQ+LKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK
CF..4_0475 +467457 NQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNFVTKIAGGMKNAELIGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGYGQEFAAQYLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK +467754
CF..0_0465 +201 KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKN +300
KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKN
CF..4_0475 +467157 KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKN +467454
CF..0_0465 +301 PIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGGGSA +400
PIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGGGSA
CF..4_0475 +466857 PIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGGGSA +467154
CF..0_0465 +401 TNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANVADIYGGKsisnnsianknsitisGGTLQVTNIYGGHSAKDAnensiqisnggninni +500
TNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTAN+ADIYGGKSISNNSIANKNSITISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSIQISNGGNINNI
CF..4_0475 +466557 TNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANIADIYGGKSISNNSIANKNSITISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSIQISNGGNINNI +466854
CF..0_0465 +501 vggHAQDHtnlntinitggtiQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATRNSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSVTISGGKVTNSI +600
VGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSAT+NSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSVTISGGKVTNSI
CF..4_0475 +466257 VGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATKNSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSVTISGGKVTNSI +466554
CF..0_0465 +601 YGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTENSVNISNGTITG +700
YGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTENSVNISNGTITG
CF..4_0475 +465957 YGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTENSVNISNGTITG +466254
CF..0_0465 +701 NIYGGYAKVAFKNVVAISGGTIVgniyggyssgggsstgnkiiisgsPDLSNATLYGADGKIAAPPPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKS +800
NIYGGYAKVA KNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAA PPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKS
CF..4_0475 +465657 NIYGGYAKVASKNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAA-PPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKS +465954
CF..0_0465 +801 GNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNEGDTITLIGGFDDAKITGGDDANS +887
GNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNEGDTITLIGGFDDAKITGGDDANS
CF..4_0475 +465357 GNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNEGDTITLIGGFDDAKITGGDDANS +465615
Score: 1527.00 bits: 662.51 e-value: 0.000000
length: 340 gaps: 0 id: 340 positives: 340 coverage: 0.96 query coverage 0.95
CF..0_0465 +948 LVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVsqasssnsfaalsNGRFRYKTGSHIDINGFSLI +1047
LVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLI
CF..4_0475 +464970 LVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLI +465267
CF..0_0465 +1048 VGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHI +1147
VGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHI
CF..4_0475 +464670 VGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHI +464967
CF..0_0465 +1148 GLGRifnindiniidLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDSTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAML +1247
GLGRIFNINDINIIDLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDSTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAML
CF..4_0475 +464370 GLGRIFNINDINIIDLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDSTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAML +464667
CF..0_0465 +1248 EIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKARYKF +1287
EIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKARYKF
CF..4_0475 +464070 EIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKARYKF +464187
CFF8240_0465 vs: CSG_5400 in 84-112 (Campylobacter fetus subsp. venerealis str. 84-112, complete genome.)
Gene length: 2983bp / 994aa PV: Yes
Function: putative autotransporter proteinScore: 1724.00 bits: 747.49 e-value: 0.000000
length: 478 gaps: 0 id: 471 positives: 473 coverage: 0.94 query coverage 0.72
CF..0_0465 +290 VTIATHSSLKNPIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGT +389
V IATHSSLKNPIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGG SQVASENLVIISGGT
CSG_5400 +535372 VIIATHSSLKNPIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGSSQVASENLVIISGGT +535669
CF..0_0465 +390 INVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANVADIYGGKsisnnsianknsitisGGTLQVTNIYGGHSAKDAnensi +489
INVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTAN+ADIYGGKSISNNSIANKNSITISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSI
CSG_5400 +535672 INVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANIADIYGGKSISNNSIANKNSITISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSI +535969
CF..0_0465 +490 qisnggninnivggHAQDHtnlntinitggtiQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATRNSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSV +589
QISNGGNINNIVGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSAT+NSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSV
CSG_5400 +535972 QISNGGNINNIVGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATKNSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSV +536269
CF..0_0465 +590 TISGGKVTNSIYGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTEN +689
TISGGKVTNSIYGGKSTN NANKNSV ISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTEN
CSG_5400 +536272 TISGGKVTNSIYGGKSTNSNANKNSVIISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTEN +536569
CF..0_0465 +690 SVNISNGTITGNIYGGYAKVAFKNVVAISGGTIVgniyggyssgggsstgnkiiisgsPDLSNATLYGADGKIAAPPP +767
SVNISNGTITGNIYGGYAKVA KNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAAPPP
CSG_5400 +536572 SVNISNGTITGNIYGGYAKVASKNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAAPPP +536803
Score: 606.00 bits: 265.22 e-value: 0.000000
length: 122 gaps: 0 id: 122 positives: 122 coverage: 0.94 query coverage 0.72
CF..0_0465 +766 PPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNEG +865
PPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNEG
CSG_5400 +536798 PPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNEG +537095
CF..0_0465 +866 DTITLIGGFDDAKITGGDDANS +887
DTITLIGGFDDAKITGGDDANS
CSG_5400 +537098 DTITLIGGFDDAKITGGDDANS +537161
Score: 1499.00 bits: 650.43 e-value: 0.000000
length: 340 gaps: 0 id: 337 positives: 337 coverage: 0.94 query coverage 0.72
CF..0_0465 +948 LVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVsqasssnsfaalsNGRFRYKTGSHIDINGFSLI +1047
LVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLI
CSG_5400 +537293 LVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLI +537590
CF..0_0465 +1048 VGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHI +1147
VGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHI
CSG_5400 +537593 VGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHI +537890
CF..0_0465 +1148 GLGRifnindiniidLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDSTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAML +1247
GLGRIFNIND NIIDLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELND TNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAML
CSG_5400 +537893 GLGRIFNINDTNIIDLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDGTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAML +538190
CF..0_0465 +1248 EIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKARYKF +1287
EIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKA YKF
CSG_5400 +538193 EIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKALYKF +538310
CFF8240_0465 vs: CFV97608_0520 in 97/608 (Campylobacter fetus subsp. venerealis 97/608.)
Gene length: 5499bp / 1833aa PV: Yes
Function: No annotation dataScore: 1364.00 bits: 592.20 e-value: 0.000000
length: 291 gaps: 0 id: 285 positives: 288 coverage: 0.73 query coverage 1.03
CF..0_0465 +1 MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPN +100
MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTI+GNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGN YPN
CF..8_0520 +506881 MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTITGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNRYPN +507178
CF..0_0465 +101 NQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNSVTKIAGGMKNAELIGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGYEQGYIAQHLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK +200
QKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNSVT IAGG+KNAEL+GGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGYEQGYIAQHLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK
CF..8_0520 +507181 SQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNSVTTIAGGVKNAELMGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGYEQGYIAQHLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK +507478
CF..0_0465 +201 KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVT +291
KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVT
CF..8_0520 +507481 KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVT +507751
Score: 110.00 bits: 51.27 e-value: 0.000000
length: 402 gaps: 101 id: 118 positives: 170 coverage: 0.73 query coverage 1.03
CF..0_0465 +52 TDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTF-IGNLYPNNQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNSVTKIAGGMKNAELIGGYATT +151
T+ +NN VTISG + + IYGG ++ + N + + GT I ++Y GGK I SNN + +N NS+T G ++ + GG++
CF..8_0520 +509767 TNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNAN-KSANENKVTITEGTANIADIY------GGKSI-------SNNSI----ANKNSITISGGTLQVTNIYGGHS-A +510064
CF..0_0465 +152 SESKNNTVLIDNKTVFYGGYEQGYIAQHLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIKKDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGL +251
++ N++ I N GG NI GG+++ N I GG +++ N ++S N V ++ +
CF..8_0520 +510067 KDANENSIQISN-----GGNIN---------NIVGGHAQDHT------------------NLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVV---- +510364
CF..0_0465 +252 RFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKNPIIDIFGGLSKDA-TTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYH +351
+IIGG++ S A N V ++ T A I GG +A +N VTI SG + IY G
CF..8_0520 +510367 --------ENYIIGGKSY--------SGSATKNSVIVSTDTSAI----------IIGGQGTNANAIENSVTI----------SGGKVTNSIY-GGKSTNS +510664
CF..0_0465 +352 QSNRNKVYIQ-DNSKIKAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNA-NKSANENKVTITEGTANVADIY +451
+N+N V I DN+ I + I GG ASEN + IS G I I GG T + N VTISGG VTS IYGG + N + EN V I+ GT +IY
CF..8_0520 +510667 NANKNSVIISGDNTSI--TDKIYGGEGISASENRIEISNGKIS-GEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSN-IYGGKSLNGNSTENSVNISNGTI-TGNIY +510964
CF..0_0465 +452 GG +453
GG
CF..8_0520 +510967 GG +510970
Score: 2331.00 bits: 1009.33 e-value: 0.000000
length: 598 gaps: 0 id: 591 positives: 593 coverage: 0.73 query coverage 1.03
CF..0_0465 +290 VTIATHSSLKNPIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGT +389
V IATHSSLKNPIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGG SQVASENLVIISGGT
CF..8_0520 +509434 VIIATHSSLKNPIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGSSQVASENLVIISGGT +509731
CF..0_0465 +390 INVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANVADIYGGKsisnnsianknsitisGGTLQVTNIYGGHSAKDAnensi +489
INVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTAN+ADIYGGKSISNNSIANKNSITISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSI
CF..8_0520 +509734 INVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANIADIYGGKSISNNSIANKNSITISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSI +510031
CF..0_0465 +490 qisnggninnivggHAQDHtnlntinitggtiQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATRNSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSV +589
QISNGGNINNIVGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSAT+NSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSV
CF..8_0520 +510034 QISNGGNINNIVGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATKNSVIVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSV +510331
CF..0_0465 +590 TISGGKVTNSIYGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTEN +689
TISGGKVTNSIYGGKSTN NANKNSV ISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTEN
CF..8_0520 +510334 TISGGKVTNSIYGGKSTNSNANKNSVIISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTEN +510631
CF..0_0465 +690 SVNISNGTITGNIYGGYAKVAFKNVVAISGGTIVgniyggyssgggsstgnkiiisgsPDLSNATLYGADGKIAAPPPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQ +789
SVNISNGTITGNIYGGYAKVA KNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAAPPPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQ
CF..8_0520 +510634 SVNISNGTITGNIYGGYAKVASKNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAAPPPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQ +510931
CF..0_0465 +790 PLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNEGDTITLIGGFDDAKITGGDDANS +887
PLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNEGDTITLIGGFDDAKITGGDDANS
CF..8_0520 +510934 PLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNEGDTITLIGGFDDAKITGGDDANS +511225
Score: 1511.00 bits: 655.61 e-value: 0.000000
length: 340 gaps: 0 id: 337 positives: 337 coverage: 0.73 query coverage 1.03
CF..0_0465 +948 LVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVsqasssnsfaalsNGRFRYKTGSHIDINGFSLI +1047
LVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLI
CF..8_0520 +511357 LVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLI +511654
CF..0_0465 +1048 VGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHI +1147
VGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHI
CF..8_0520 +511657 VGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHI +511954
CF..0_0465 +1148 GLGRifnindiniidLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDSTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAML +1247
GLGRIFNIND NIIDLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELND TNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAML
CF..8_0520 +511957 GLGRIFNINDTNIIDLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDGTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAML +512254
CF..0_0465 +1248 EIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKARYKF +1287
EIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKA YKF
CF..8_0520 +512257 EIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKALYKF +512374
CFF8240_0465 vs: CFVI03293_0466 in cfvi03/293 (Campylobacter fetus subsp. venerealis cfvi03/293, complete genome.)
Gene length: 3860bp / 1286aa PV: Yes
Function: No annotation dataScore: 1760.00 bits: 763.02 e-value: 0.000000
length: 369 gaps: 0 id: 369 positives: 369 coverage: 1.11 query coverage 1.11
CF..0_0465 +1 MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPN +100
MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPN
CF..3_0466 +459812 MKIQIPITTIVGAKITLSTLLLCIPISSVAELNVNNNGNAISKGQGNTYKPTDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPN +460109
CF..0_0465 +101 NQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNSVTKIAGGMKNAELIGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGYEQGYIAQHLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK +200
NQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNSVTKIAGGMKNAELIGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGYEQGYIAQHLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK
CF..3_0466 +460112 NQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNSVTKIAGGMKNAELIGGYATTSESKNNTVLIDNKTVFYGGYEQGYIAQHLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK +460409
CF..0_0465 +201 KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKN +300
KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKN
CF..3_0466 +460412 KDIELTATSDNQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDAKLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKN +460709
CF..0_0465 +301 PIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEI +369
PIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEI
CF..3_0466 +460712 PIIDIFGGLSKDATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEI +460916
Score: 110.00 bits: 51.27 e-value: 0.000000
length: 409 gaps: 115 id: 118 positives: 162 coverage: 1.11 query coverage 1.11
CF..0_0465 +52 TDQSNNNVTISGNEPQGAEIYGGYSDSEETKSNTINVDPGTFIGNLYPNNQKNGGKVIGGKGTSSSNNKVEIKSSNTNSVTKIAGGMKNAELIGGYATTS +151
T+ +NN VTISG + + IYGG ++ KS+N N VT G A++ GG + +
CF..3_0466 +461011 TNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNAN----------------------------------------------KSANENKVTITEGTANVADIYGGKSIS- +461308
CF..0_0465 +152 ESKNNTVLIDNKTVFYGGYEQGYIAQHLKSNIYGGQSKSTATSNKVEIK-----KDIELTATSD--NQHQFKIAGGFVEAPNKNNGKAISSNNSVIITDA +251
NN++ N GG Q +NIYGG+S A N ++I +I D N I GG +++ N ++S N V ++
CF..3_0466 +461311 ---NNSIANKNSITISGGTLQ-------VTNIYGGHSAKDANENSIQISNGGNINNIVGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGG +461608
CF..0_0465 +252 KLTAGLRFGNKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKNPIIDIFGGLSKDA-TTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIK +351
+ +IIGG++ S A N V ++ T A I GG +A +N VTI SG + IY
CF..3_0466 +461611 VV------------ENYIIGGKSY--------SGSATRNSVIVSTDTSAI----------IIGGQGTNANAIENSVTI----------SGGKVTNSIY-- +461908
CF..0_0465 +352 GGNGYH-QSNRNKVYIQ-DNSKIKAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNA-NKSANENKVTITEGT +451
GG +N+N V I DN+ I + I GG ASEN + IS G I I GG T + N VTISGG VTS IYGG + N + EN V I+ GT
CF..3_0466 +461911 GGKSTNGNANKNSVTISGDNTSI--TDKIYGGEGISASENRIEISNGKIS-GEIYGGYGTTVSKNSVTISGGTVTSN-IYGGKSLNGNSTENSVNISNGT +462208
CF..0_0465 +452 ANVADIYGG +460
+IYGG
CF..3_0466 +462211 I-TGNIYGG +462235
Score: 124.00 bits: 57.31 e-value: 0.000000
length: 266 gaps: 50 id: 83 positives: 116 coverage: 1.11 query coverage 1.11
CF..0_0465 +217 IAGGFVEAPNKNNGKAI-SSNNSVIITDAKLTAGLRFG---NKLQHHTHIIGGEASVFWNFDYGSAEAIGNMVNLTNVTIATHSSLKNPIIDIFGGLSKD +316
I+GG + P G A ++NN V I+ K+T+ +G NK + E + YG N + N + +L+ + +I+GG S
CF..3_0466 +460963 ISGGTINVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANVADIYGGKSISNNSIANKNSITISGGTLQ--VTNIYGGHSAK +461260
CF..0_0465 +317 ATTDNVVTIKGNTKINWDGSGSASSTKIYIKGGNGYHQSNRNKVYIQDNSKIKAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGG----GSAT------- +416
+N + I IN I GG ++N N + I + I++V GG VAS+N V +SGG + IGG GSAT
CF..3_0466 +461263 DANENSIQISNGGNINN------------IVGGHAQDHTNLNTINITGGT-IQSVT--GGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATRNSVIVS +461560
CF..0_0465 +417 ---------------NATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNA-NKSANENKVTITEGTANVAD-IYGGK +482
NA N VTISGGKVT S IYGG + N AN+N VTI+ + D IYGG+
CF..3_0466 +461563 TDTSAIIIGGQGTNANAIENSVTISGGKVTNS-IYGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGE +461758
Score: 1970.00 bits: 853.61 e-value: 0.000000
length: 523 gaps: 1 id: 518 positives: 519 coverage: 1.11 query coverage 1.11
CF..0_0465 +365 KAVEIIGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANVADIYGGKsisnnsianknsit +464
K+ IGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANVADIYGGKSISNNSIANKNSIT
CF..3_0466 +460903 KSRRNIGGGRSQVASENLVIISGGTINVPTIGGGSATNATNNQVTISGGKVTSSTIYGGNANKSANENKVTITEGTANVADIYGGKSISNNSIANKNSIT +461200
CF..0_0465 +465 isGGTLQVTNIYGGHSAKDAnensiqisnggninnivggHAQDHtnlntinitggtiQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATRNSV +564
ISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSIQISNGGNINNIVGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATRNSV
CF..3_0466 +461203 ISGGTLQVTNIYGGHSAKDANENSIQISNGGNINNIVGGHAQDHTNLNTINITGGTIQSVTGGNSGVVASQNYVNVSGGVVENYIIGGKSYSGSATRNSV +461500
CF..0_0465 +565 IVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSVTISGGKVTNSIYGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNS +664
IVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSVTISGGKVTNSIYGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNS
CF..3_0466 +461503 IVSTDTSAIIIGGQGTNANAIENSVTISGGKVTNSIYGGKSTNGNANKNSVTISGDNTSITDKIYGGEGISASENRIEISNGKISGEIYGGYGTTVSKNS +461800
CF..0_0465 +665 VTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTENSVNISNGTITGNIYGGYAKVAFKNVVAISGGTIVgniyggyssgggsstgnkiiisgsPDLSNATLYGADGKIAA +764
VTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTENSVNISNGTITGNIYGGYAKVAFKNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAA
CF..3_0466 +461803 VTISGGTVTSNIYGGKSLNGNSTENSVNISNGTITGNIYGGYAKVAFKNVVAISGGTIVGNIYGGYSSGGGSSTGNKIIISGSPDLSNATLYGADGKIAA +462100
CF..0_0465 +765 PPPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNE +864
PPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNE
CF..3_0466 +462103 -PPPIEQNLAPKRVRRALADPADIQPLNDPPSDYKSGNTLATQDSLNLKIKSIKNFSNLNLNIPRDMTTNDYILILGEDMDLSDLIITPQFNANNLNLNE +462400
CF..0_0465 +865 GDTITLIGGFDDAKITGGDDANS +887
GDTITLIGGFDDAKITGGDDANS
CF..3_0466 +462403 GDTITLIGGFDDAKITGGDDANS +462469
Score: 1523.00 bits: 660.79 e-value: 0.000000
length: 340 gaps: 0 id: 340 positives: 340 coverage: 1.11 query coverage 1.11
CF..0_0465 +948 LVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVsqasssnsfaalsNGRFRYKTGSHIDINGFSLI +1047
LVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLI
CF..3_0466 +462649 LVSEPKKTLFGVSQIITYTSVGNSKFVLGKKEPNPGMKSFLESGVASIVSTNQAGDLASNEGIKNMVSQASSSNSFAALSNGRFRYKTGSHIDINGFSLI +462946
CF..0_0465 +1048 VGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHI +1147
VGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHI
CF..3_0466 +462949 VGVSKEIESFTYGIFMEAGNANYNSYNDFAPNSIPNTNSIKGSGDTNYFGIGVLLNTKLANNFYLDGSLRGGKVKSNYVSNDFNGVASFDMGRNYFGGHI +463246
CF..0_0465 +1148 GLGRifnindiniidLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDSTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAML +1247
GLGRIFNINDINIIDLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDSTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAML
CF..3_0466 +463249 GLGRIFNINDINIIDLYSKILYSEQGSKAVYIRDEGFEFDTAKSIRLSLGARYNYELNDSTNLYGGAAYEREFDGKQKTYSIVANANIDAPGASGDSAML +463546
CF..0_0465 +1248 EIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKARYKF +1287
EIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKARYKF
CF..3_0466 +463549 EIGASITPTNYKAFNANFNLQLFTGVKSGISGGLKARYKF +463666