Strain name: 1485E
Filepath: ../polyG/campy.new\201601-669187427.gb
Species: C. iguaniorum
Created: 2018-09-09 12:25:37 (W. Europe Summer Time)
TractNo | Contig | Location | Tract | On length | Gene Group | Offset from gene | Gene | Length | Function | NCTC 11168 | 81-176 | PT14 | 00-0949 | 00-1597 | 00-2425 | 00-2426 | 00-2538 | 00-2544 | 00-6200 | 01-1512 | 269.97 | 4031 | 32488 | 35925B2 | 81116; NCTC 11828 | CG8421 | CJ677CC519 | CJM1cam | F38011 | IA3902 | ICDCCJ07001 | M1 | MTVDSCj20 | NCTC11351 | OD267 | R14 | RM1221 | RM1285 | RM3194 | RM3196 | RM3197 | S3 | WP2202 | YH001 | 15-537360 | BFR-CA-9557 | CVM N29710 | FB1 | HC2-48 | OR12 | RM1875 | RM4661 | RM5611 | YH501 | 13826 | ATCC 33237 | 525.92 | 03-427 | 04/554 | 82-40 | 84-112 | 97/608 | SP3 | cfvi03/293 | pet-3 | ATCC 33236 | ATCC BAA-381 | CCUG 27631 | LMG 9260 | 1485E | 2463D | RM11343 | NCTC 12927 | CCUG 22395 | LMG 11760 | NCTC 11845 | RM2100; ATCC BAA-1060D | RM16701 | RM16712 | Slaughter Beach | LMG 23910 | RM16704 | LMG 24374 | LMG 24377 | RIGS 9880 | LMG 24379 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | CP009043 | 8652 | C9 | 9 | 236 | 0 | CIG1485E_0008 | 685 | autotransporter domain protein | CIG1485E_0008 CIG1485E_0796 CIG1485E_1594 CIG1485E_1021 CIG1485E_0473 | CIG2463D_0797 CIG2463D_1074 CIG2463D_1791 CIG2463D_0008 CIG2463D_0474 | CIG11343_0424 CIG11343_0986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | CP009043 | 28581 | A10 | None | 362 | -22 | 22bp upstream of CIG1485E_0022 | 349 | hypothetical membrane protein, EpsG family | CHH_0019 | CIG1485E_0022 | CIG2463D_0022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | CP009043 | 28591 | G9 | 10 | 362 | 0 | 1485E [0] | 354 | No data, identified by script | CHH_0019 | CIG1485E_0022 | CIG2463D_0022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | CP009043 | 30664 | G9 | 9 | 363 | 0 | CIG1485E_0023 | 371 | glycosyltransferase, family 1 | CHL_0081 | CHH_0020 | CIG1485E_0023 | CIG2463D_0023 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | CP009043 | 35073 | G8 | 9 | 394 | 0 | CIG1485E_0027 | 213 | sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family | CCC13826_2304 | CIG1485E_0027 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | CP009043 | 38757 | G9 | 9 | 395 | 0 | CIG1485E_0031 | 310 | formyltransferase domain-containing protein | JJD26997_0383 | CIG1485E_0031 | Cla_1233 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 | CP009043 | 44062 | G9 | 9 | 60 | 0 | CIG1485E_0037 | 228 | deacetylase, PIG-L family | JJD26997_0382 | CIG1485E_0037 | CONCH_0308 | Cla_1232 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 | CP009043 | 45527 | G10 | 10 | 396 | 0 | CIG1485E_0039 | 251 | glycosyl amidation-associated protein WbuZ | CIG1485E_0039 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8 | CP009043 | 48029 | C10 | 10 | 397 | 0 | CIG1485E_0042 | 239 | SAM-dependent methyltransferase | CIG1485E_0042 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9 | CP009043 | 49153 | G9 | 9 | 54 | 0 | CIG1485E_0043 | 370 | N-acetyl sugar amidotransferase | Cj1324 | A911_06435 | PJ16_07370 | PJ17_07010 | N135_01412 | N564_02245 | N565_02335 | N755_02395 | PJ19_07370 | JJD26997_0389 | M635_02315 | CJ8421_06605 | ERS445056_01436 | A0W68_07120 | H730_07580 | AXW77_06525 | A0W69_07800 | N149_1288 | AB430_08285 | G157_02195 | VC76_06650 | ATE51_00916 | YSQ_02225 | YSS_07195 | A6K30_02200 | CIG1485E_0043 | CINS_1196 | CD56_06370 | CSUB8521_1419 | CSUB8523_1519 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10 | CP009043 | 51668 | G9 | 9 | 398 | 0 | CIG1485E_0045 | 258 | CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase | CIG1485E_0045 | CD56_06350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
11 | CP009043 | 56276 | G9 | 9 | 399 | 0 | CIG1485E_0050 | 419 | hypothetical protein | CIG1485E_0050 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
12 | CP009043 | 57551 | G9 | 10 | 400 | 0 | CIG1485E_0051 | 431 | No annotation data | CIG1485E_0051 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
13 | CP009043 | 58813 | G8 | 8 | 401 | 0 | CIG1485E_0052 | 259 | SAM-dependent methyltransferase | CIG1485E_0052 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
14 | CP009043 | 86120 | G10 | 10 | 402 | 0 | CIG1485E_0074 | 155 | hypothetical type II secretion system protein | CIG1485E_0074 | CIG2463D_0077 | CIG11343_0034 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
15 | CP009043 | 142699 | AT6 | None | 403 | -63 | 63bp upstream of CIG1485E_0147 | 289 | glucose-1-phosphate thymidylyltransferase | BN867_11270 | C8J_1076 | CJ8421_05645 | RC25_05360 | CJM1cam_1114 | CJM1_1114 | MTVDSCj20_1139 | N149_1392 | AR446_02545 | ATE51_01304 | YSQ_03235 | YSU_03265 | CCV52592_0305 | CIG1485E_0147 | UPTC4110_1219 | UPTC16701_1227 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
16 | CP009043 | 275581 | G9 | 9 | 404 | 0 | CIG1485E_0289 | 690 | TonB-dependent receptor | CFT03427_0282 | CFF04554_0275 | CFF8240_0276 | CSG_3570 | CFV97608_0277 | CFTSP3_0280 | CFVI03293_0275 | CR44_01420 | CIG1485E_0289 | CIG2463D_0294 | CIG11343_0236 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
17 | CP009043 | 385501 | G10 | 11 | 15 | 0 | CIG1485E_0398 | 424 | No annotation data | Cj1295 | A911_06290 | PJ16_07255 | PJ17_06865 | N135_01383 | N564_01313 | N565_02300 | N755_01345 | PJ18_06675 | PJ19_07255 | JJD26997_0427 | BN867_12880 | M635_08875 | UC78_1247 | C8J_1238 | CJ8421_06450 | RC25_06170 | CJM1cam_1277 | CJH_06560 | CJSA_1233 | ICDCCJ07001_1243 | CJM1_1277 | MTVDSCj20_1301 | ERS445056_01406 | A0W68_06980 | H730_07425 | CJE1487 | CjjRM1285_1309 | AXW77_06385 | CjjRM3196_1311 | CjjRM3197_1311 | CJS3_1392 | A0W69_07665 | QZ67_01430 | N149_1256 | AB430_08160 | VC76_06500 | AR446_01680 | ATE51_00974 | YSQ_02385 | YSS_07030 | YSU_02410 | A6K30_02350 | CFT03427_1431 | CFF04554_1483 | CFF8240_1468 | CSG_16050 | CFV97608_1605 | CFTSP3_1495 | CFVI03293_1505 | CR44_07250 | CHL_1692 | CHH_1509 | CIG1485E_0398 | CIG2463D_0403 | CIG11343_0347 | CINS_1263 | UPTC4110_1286 | CONCH_1253 | UPTC3659_1523 | Cla_1300 | UPTC16701_1283 | UPTC16712_1302 | CD56_06695 | CPEL_1409 | CAQ16704_1312 | CSUB8521_1489 | CSUB8523_1585 | CVOL_1279 CVOL_1280 | ||||||||
18 | CP009043 | 389364 | G10 | 10 | 29 | 0 | CIG1485E_0401 | 244 | formyltransferase domain-containing protein | JJD26997_0414 | AR446_01620 | CHL_1689 | CIG1485E_0401 | CIG11343_0350 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
19 | CP009043 | 465644 | C9 | 9 | 236 | 0 | CIG1485E_0473 | 685 | autotransporter domain protein | CIG1485E_0008 CIG1485E_0796 CIG1485E_1594 CIG1485E_1021 CIG1485E_0473 | CIG2463D_0797 CIG2463D_1074 CIG2463D_1791 CIG2463D_0008 CIG2463D_0474 | CIG11343_0424 CIG11343_0986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
20 | CP009043 | 530078 | G10 | None | 405 | -277 | 277bp upstream of CIG1485E_0543 | 286 | hypothetical protein | CIG1485E_0543 | CIG2463D_0543 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
21 | CP009043 | 601145 | G8 | 8 | 406 | 0 | CIG1485E_0617 | 1130 | autotransporter domain protein | CIG1485E_0617 | CIG2463D_0617 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
22 | CP009043 | 656514 | G10 | 10 | 407 | 0 | CIG1485E_0654 | 946 | autotransporter domain protein | CIG1485E_0654 | CIG2463D_0654 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
23 | CP009043 | 810175 | C8 | 7 | 236 | 0 | CIG1485E_0796 | 639 | No annotation data | CIG1485E_0008 CIG1485E_0796 CIG1485E_0473 | CIG2463D_0797 CIG2463D_0008 CIG2463D_0474 | CIG11343_0424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
24 | CP009043 | 820977 | G9 | 8 | 408 | 0 | CIG1485E_0808 | 232 | No annotation data | CIG1485E_0808 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
25 | CP009043 | 955154 | G8 | 8 | 348 | 0 | CIG1485E_0946 | 484 | membrane bound O-acyl transferase, MBOAT family | BN867_11440 | C8J_1093 | CJM1cam_1130 | CJM1_1130 | MTVDSCj20_1154 | CCV52592_0864 | CFT03427_1695 | CFF04554_1747 | CFF8240_1751 | CSG_18810 | CFV97608_1874 | CFTSP3_1760 | CFVI03293_1771 | CR44_08610 | CHL_0862 | CHH_0868 | CIG1485E_0946 | CIG2463D_0946 | CIG11343_0927 | CINS_1186 | UPTC4110_1214 | CD56_06335 | CVOL_1205 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
26 | CP009043 | 1026322 | T12 | None | 381 | -61 | 61bp upstream of CIG1485E_1015 | 210 | outer membrane beta-barrel domain protein | CHH_0814 | CIG1485E_1015 | CIG2463D_1068 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
27 | CP009043 | 1033259 | G11 | 11 | 236 | 0 | CIG1485E_1021 | 716 | autotransporter domain protein | CIG1485E_0008 CIG1485E_1021 CIG1485E_0473 | CIG2463D_1074 CIG2463D_0008 CIG2463D_0474 | CIG11343_0424 CIG11343_0986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
28 | CP009043 | 1083227 | G8 | None | 409 | -34 | 34bp upstream of CIG1485E_1074 | 115 | hypothetical protein | CIG1485E_1074 | CIG2463D_1166 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
29 | CP009043 | 1170599 | G8 | 7 | 410 | 0 | CIG1485E_1167 | 411 | hypothetical membrane protein | CIG1485E_1167 | CIG2463D_1258 | CIG11343_1121 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
30 | CP009043 | 1219690 | G10 | 10 | 342 | 0 | CIG1485E_1223 | 775 | autotransporter domain protein | CHH_0746 CHH_1466 | CIG1485E_1223 | CIG2463D_1314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
31 | CP009043 | 1219846 | G9 | None | 411 | -45 | 45bp upstream of CIG1485E_1224 | 53 | hypothetical protein | CIG1485E_1224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
32 | CP009043 | 1440277 | C12 | None | 412 | -166 | 166bp upstream of CIG1485E_1451 | 597 | hypothetical protein | CHH_0151 | CIG1485E_1451 CIG1485E_0159 | CIG2463D_1644 CIG2463D_0162 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
33 | CP009043 | 1485265 | G10 | 10 | 332 | 0 | CIG1485E_1500 | 391 | ATP-grasp domain-containing protein | CJH_06665 | CHL_0231 | CHH_1590 | CIG1485E_1499 CIG1485E_1500 | CIG2463D_1693 CIG2463D_1692 | CIG11343_1444 CIG11343_1443 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
34 | CP009043 | 1489569 | G9 | 9 | 334 | 0 | CIG1485E_1504 | 340 | aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family | CHL_0240 | CHH_1599 | CIG1485E_1504 | CIG2463D_1701 | CIG11343_1453 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
35 | CP009043 | 1575194 | G10 | 10 | 236 | 0 | CIG1485E_1594 | 815 | autotransporter domain protein | CIG1485E_1594 | CIG2463D_1791 CIG2463D_0008 CIG2463D_0474 | CIG11343_0424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
36 | CP009043 | 1588250 | C8 | 8 | 321 | 0 | CIG1485E_1607 | 537 | phosphoglycerol transferase | CHL_0019 | CHH_1700 | CIG1485E_1607 | CIG2463D_1804 | CIG11343_1542 |