Presentation: Ferramentas para ciência aberta

Seminário apresentado nas Palestras Estudantis do Observatório Nacional.

 

Link abaixo para o repositório do GitHub que acompanha a apresentação (criado na demostração). Este repositório contem um molde para produzir um artigo usando git, IPython notebook e make.

 

Resumo

O processo científico produz muito mais do que é eventualmente publicado em revistas. Fazer pesquisa involve geração de dados, código, análise, figuras, pôster/apresetações, etc. No entanto, somente uma fração pequena disso é publicada e geralmente exclui resultados considerados "negativos". Isso leva uma grande reprodução de trabalho para descobrir o que "não funciona", já que esses resultados nunca alcaçam a comunidade científica. Além disso, a publicação geralmente ocorre através de documentos estáticos (PDF) que parecem até pré-históricos quando comparados ao que estamos acostumados no mundo interativo da internet. O movimento para maior abertura do processo científico (open-science) tem promovido o uso de tecnologias emergentes para facilitar a publicação imediata de todos os produtos de uma pesquisa. Alguns prestadores de serviços se destacam dentre as várias opções disponíveis. O GitHub é o mais popular serviço de hospedagem de código e colaboração. Para a linguagem de programação Python, o IPython notebook permite a integração de código, texto, tabelas e figuras em um único documento. A página figshare.com rapidamente se tornou o padrão para publicação de dados, figuras, apresentações, material suplementar, videos, etc. Nesta apresentação, falarei sobre como utilizar esses serviços e as vantágens e de tornar sua pesquisa mais aberta e reprodutível.