Fundus-AVSeg:用于基于 AI 的动脉静脉分割的眼底图像数据集
抽象
视网膜动脉静脉血管与全身性慢性疾病和心血管疾病有关。因此,视网膜动脉静脉血管的准确定量分析是临床诊断的初步依据。大多数现有的人工智能 (AI) 方法都是数据驱动的。虽然已经发布了一些公共视网膜动脉静脉分割数据集,但其数据质量并不令人满意。在本文中,我们为基于 AI 的动脉静脉分割建立了一个新的眼底图像数据集 Fundus-AVSeg。它由 100 张高分辨率眼底图像组成,并由专业眼科医生进行像素级手动注释。我们相信我们的 Fundus-AVSeg 将有利于视网膜动脉-静脉血管分割的进一步发展。
数据信息
Fundus-AVSeg 包含 100 张眼底图像,其中 40 张来自正常眼底,20 张来自糖尿病视网膜病变 (DR) 患者,20 张来自年龄相关性黄斑变性 (AMD),20 张来自青光眼。图像有两种分辨率:2656×1992 和 1280×1280。像素级手动注释类别包括动脉、静脉、动脉-静脉交叉和类别不确定的血管。还为每张图像提供了两个图像质量类别:低质量和高质量。
数据采集
Fundus-AVSeg 的数据来源是深圳眼科医院。所有 100 张眼底图像均来自深圳市眼科医院的影像数据库。眼底图像由眼科医生使用蔡司VISUCAM200眼底相机或佳能眼底相机拍摄,这些都是眼底相机的主流产品。所有眼底图像都是在真实的临床诊断过程中生成的。所有伦理和实验程序和协议均由深圳眼科医院根据道德编号 2022KYPJ062 授予。
数据记录
Fundus-AVSeg 数据集已以压缩文件的形式上传到 Figshare。解压后的文件包含两个文件夹和一个Microsoft Office Excel 列表,以及两个 txt 格式的文件,分别命名为 ''images''、''annotation'' 、''metadata.xlsx''、'training.txt'' 和 ''testing.txt'' 。在 ''images'' 文件夹中,有 100 张眼底图像。图像被命名为 ''n\_D/A/G/N.png“,其中 ''n'' 表示眼底图像的数量,''D''、''A''、'G'' 和 ''N'' 代表 ''DR''、'AMD''、'青光眼'' 和 ''正常''。''annotation'' 文件夹包含 100 张对应的带注释的图像,这些图像按照相同的规则命名,其中该文件夹中的特定图像是 ''images'' 中同名图像的基本事实。“metadata.xlsx”是一个 Excel 文件,其中包含以下信息:图像名称、眼睛 ID、疾病类型和图像质量。''training.txt'' 和 ''testing.txt'' 文件分别存储用于训练和测试的特定图像名称,按照数据集的 8:2 分割。请注意,当前的数据拆分策略是我们推荐的,可以根据不同的研究目的进行更改。
使用说明
完整的数据集可通过提供的链接下载。用户可以根据其特定的研究设计灵活地划分数据集。预计用户将在他们的研究中引用这篇论文,并认识到数据集对他们研究的贡献。
代码可用性
本研究中提到的代码可以在 https://github.com/AI-thpremed/Basic-Seg-Experiment 中找到。