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Caracterização de microssatélites em regiões codificadoras do genoma de Salminus basilienses

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posted on 2025-03-14, 17:00 authored by Gabriel YazbeckGabriel Yazbeck, Karine Chaves de Sá Antunes, Raissa GracianoRaissa Graciano

Tabela 1 das sequências consideradas como identificadas (confirmados no GenBank) de caracterização de regiões microssatélites presentes na região codificante do genoma de Salminus brasiliensis. Apresentando o Número de pares de base, o Motivo e a condição de ser ou não múltiplo de três para cada microssatélite encontrado. Seguido pelo resultado principal da busca por meio de BLAST nas sequências depositadas no banco de dados GenBank, do National Center for Biotechnology Information (NCBI), sendo apresentado a descrição e código de avaliação dos resultados obtidos, seguidos pelo ID (rótulo segundo o sistema HUGO) da proteína identificada. Tabela 2: Sequências consideradas como não identificadas (não confirmados ou sem concordância com o GenBank) de caracterização de genes de microssatélite presentes na região codificante do genoma de Salminus brasiliensis. Apresentando o Número de pares de base, o Motivo e a condição de ser ou não múltiplo de três para cada microssatélite encontrado. Seguido pelo resultado principal da busca por meio de BLAST nas sequências depositadas no banco de dados GenBank, do National Center for Biotechnology Information (NCBI), sendo apresentado a descrição e código de avaliação dos resultados obtidos, seguidos pelo ID (rótulo segundo o sistema HUGO) da proteína identificada. Foram consideradas sequências não identificadas transcritos sem correspondência no banco de dados, bem como as sequências cujos resultados apresentaram baixa confiabilidade ou sem a confirmação dos microssatélites no resultado da busca. Tabela 3: Sequências consideradas como identificadas (confirmados no GenBank) de caracterização funcional de genes de microssatélite presentes na região codificante do genoma de Salminus brasiliensis. Apresentando ID (rótulo segundo o sistema HUGO) da proteína identificada, Resultado da busca funcional de proteínas através do programa OmicsBox (v. 3.0.30), com a utilização da ferramenta InterProScan (InterPro GO Names) e destaque das principais funções encontradas. Tabela 4: sequências consideradas como não identificadas (não confirmados ou sem concordância com o GenBank) de caracterização funcional de genes de microssatélite presentes na região codificante do genoma de Salminus brasiliensis. Apresentando ID (rótulo segundo o sistema HUGO) da proteína identificada, Resultado da busca funcional de proteínas através do programa OmicsBox (v. 3.0.30), com a utilização da ferramenta InterProScan (InterPro GO Names) e destaque das principais funções encontradas. Foram consideradas sequências não identificadas transcritos sem correspondência no banco de dados, bem como as sequências cujos resultados apresentaram baixa confiabilidade ou sem a confirmação dos microssatélites no resultado da busca.

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