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13015_2020_180_MOESM3_ESM.mat (75.66 MB)
Additional file 3 of Quantifying steric hindrance and topological obstruction to protein structure superposition
dataset
posted on 16.04.2021, 10:34 by Peter RøgenAdditional file 3. Data from aligning CATH2.4 domains. NeamTM3to20NoEndContraction.mat Data from global RMSD and TM-align alignments of alpha carbon backbone curves. The maximal length of Reidemeister moves is varied from 3 to 20 and end-contractions are not allowed. Similar data for the smooth representation of the backbone curve are contained in NeamTMSmooth3to20NoEndContraction.mat and in NeamTMSmooth3to20EndContraction.matwhen allowing end-contractions of MaxLength=2/residues.
History
References
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- 10.1093/bioinformatics/btp198
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- 10.1093/nar/gkm342
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- 10.1007/s000130050055
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- 10.1145/6462.6502
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- 10.1093/nar/gku947
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